核算难点
《高新技术企业认定管理办法》规定，高新技术企业认定必须满足最近三个会计年度研究开发费用总额占销售收入总额的一定比例。因此，申报企业为了达到标准可能虚列研究开发费用，扩大研究开发费用总额。
应对措施
（1）获取经具有高新技术企业认定资质的会计师事务所审计的，最近三个会计年度的审计报告和财务报表。
（2）复算加计最近三个会计年度的销售收入总额。《高新技术企业认定申请书》填报说明表明，销售收入是指产品收入和技术服务收入之和；复算加计最近三个会计年度的研究开发费用总额。
（3）复算研究开发费用总额占销售收入总额的比例，与申报企业计算的结果核对是否一致；复算在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例，与申报企业计算的结果核对是否一致。
