1.国家高新技术企业最高管理机构全国高新技术企业认定管理工作领导小组,该领导小组由科技部、财政部、税务总局相关人员构成,主要是审议、管理、裁决、监督等作用。总体来说,这个领导小组是管大方向的,具体操作层面的事情应该是不会做的。
2.中央层面具有操作性质的机构办公室,该办公室设置在科技部,直接对领导小组负责,负责中央层面的一些操作性事务,例如建立管理“高新技术企业认定管理工作网”、提供工作报告等。

4.企业层面的相关机构财务部门,企业层面的申请机构一般由财务部门进行具体操作与实施。值得注意的是,以上三(四)个层级的相关机构在2008年和2016年的高新技术企业认定管理办法中叙述维持不变。
因此,国家高新技术企业的申请、管理工作,主要涉及科技、财政、税务三个政府部门,外加企业财务部。既然国家高新技术企业有这么多好处,那么肯定是人人都想申请,毕竟单说企业所得税这一块,对于企业来说就节约很多很多钱了。